Mise à jour 2026 : les barèmes d’indemnités journalières (Pass, plafond IJ, seuil de RAAM) et les règles Cerfa ont évolué. Pour les chiffres Ameli / Urssaf actualisés, la checklist CPAM et le comparatif artisan vs profession libérale, consultez notre guide : arrêt maladie micro-entreprise 2026 (checklist IJ et démarches CPAM). Le fonctionnement pédagogique des IJ reste aussi détaillé sur la page droits aux indemnités journalières en micro-entreprise.
L’année 2020 a apporté des changements structurants pour les indépendants, et notamment pour l’assurance maladie auto-entrepreneur. Auparavant, celui-ci cotisait auprès d’un organisme spécifique (RSI devenu SSI, ou CIPAV selon les cas). Depuis le 1er janvier 2020, le basculement vers le régime général est achevé pour la majorité des micro-entrepreneurs.
Cet article rappelle le contexte du rattachement à la CPAM, le rôle de l’Urssaf et des caisses de retraite, et où s’adresser pour un arrêt maladie. Les montants d’IJ détaillés plus bas sont actualisés via les liens 2026 ; ne vous fiez plus aux anciennes fourchettes 2018–2020.
Quelle sécurité sociale pour les auto-entrepreneurs ?
Pris en charge par le régime général, les micro-entrepreneurs gèrent via la CPAM (ou CGSS dans les DROM) leurs remboursements de soins, leurs indemnités journalières et leurs prestations maternité/paternité. C’est l’aboutissement de la réforme engagée avec la loi de financement de la Sécurité sociale et la fin progressive de la SSI.
Les auto-entrepreneurs immatriculés après le 1er janvier 2019 ont été rattachés directement à la CPAM. Les dossiers encore à la SSI ont basculé automatiquement. Il n’y a plus de « choix » d’organisme d’assurance maladie entre plusieurs caisses historiques pour la couverture de base.
Rattachement à la CPAM : quelles démarches ?
Pour les immatriculations antérieures à 2019, le rattachement a été automatique. Côté pratique, deux réflexes restent utiles : mettre à jour sa carte Vitale et disposer d’un compte ameli pour suivre remboursements et IJ.
Les dossiers en cours (remboursements, maternité, paternité, arrêts) ont en principe été transférés sans démarche individuelle.
Comment cotiser pour la retraite en étant auto-entrepreneur ?
Depuis la fin de la SSI, la couverture sociale s’articule autour de trois interlocuteurs : l’Urssaf (cotisations), la CPAM (maladie / maternité / IJ) et les caisses d’assurance retraite (Cnav, Carsat, CGSS, CSS… selon le territoire).
Pour valider des trimestres, des seuils de chiffre d’affaires s’appliquent. Le tableau ci-dessous reprend les seuils 2020 (contexte historique de cet article) ; vérifiez toujours les seuils de l’année en cours sur les sites officiels avant de vous projeter.
Quel chiffre d’affaires pour valider 4 trimestres (référence 2020) ?
| CA 1 trimestre | CA 2 trimestres | CA 3 trimestres | CA 4 trimestres | |
| Vente de marchandises (BIC) | 4 137 € | 7 286 € | 10 426 € | 20 740 € |
| Prestations de services (BIC) | 2 412 € | 4 239 € | 6 071 € | 12 030 € |
| Prestations de services (BNC) | 2 880 € | 5 062 € | 7 266 € | 9 675 € |
| Profession libérale relevant de la CIPAV | 2 280 € | 4 560 € | 6 840 € | 9 120 € |
L’Urssaf auto-entrepreneur pour les cotisations sociales
L’Urssaf reste l’organisme qui collecte les cotisations sociales du micro-entrepreneur. Les déclarations de chiffre d’affaires et le paiement se font via le site ou l’application auto-entrepreneur Urssaf (et non plus via les anciens canaux net-entreprises pour cette obligation).
Les taux de cotisations évoluent selon les années ; reportez-vous à nos articles actualisés sur les cotisations et aux barèmes Urssaf de l’année en cours. Un outil comme MicroDesk aide à suivre le CA déclaré, sans se substituer aux formalités Urssaf.
La CPAM : caisse d’assurance maladie de l’auto-entrepreneur
La CPAM de votre lieu de résidence est votre interlocutrice pour la couverture santé : remboursements de soins (consultations, médicaments, hospitalisations, dentaire, optique, etc.), maternité/paternité et indemnités journalières.
Où envoyer un arrêt maladie auto-entrepreneur ?
Pour prétendre aux IJ maladie, vous devez disposer d’un avis d’arrêt de travail et transmettre les volets 1 et 2 à votre CPAM sous 48 heures lorsque le formulaire est papier (télétransmission automatique si prescription dématérialisée). Depuis le 1er juillet 2025, un Cerfa sécurisé est obligatoire pour le papier : scans et photocopies sont rejetés.
Le détail 2026 (checklist, plafonds, artisan vs libéral) : guide arrêt maladie micro-entreprise 2026. Si vous cumulez une activité salariée, votre employeur a ses propres formalités d’attestation de salaire pour les IJ.
Calcul de l’indemnité journalière maladie (rappel actualisé)
Le calcul officiel retenu par Ameli n’est pas « 0,5/365 » : l’IJ maladie est égale à 1/730e de votre revenu d’activité annuel moyen (RAAM), soit la moyenne des revenus cotisés des 3 années civiles précédant l’arrêt. Pour un auto-entrepreneur, le revenu retenu correspond au chiffre d’affaires après abattement forfaitaire (71 % BIC vente, 50 % BIC prestations, 34 % BNC).
En 2026, pour les artisans/commerçants (et assimilés PLNR micro), le revenu est plafonné au Pass (48 060 €) et l’IJ ne peut dépasser 65,84 € bruts/jour ; sous un RAAM de 4 582 €, l’IJ peut être nulle. Carence de 3 jours en règle générale. Sources et tableau comparatif : checklist IJ 2026 et page IJ MicroDesk.
Pour aller plus loin
- Arrêt maladie micro-entreprise 2026 : checklist IJ, plafonds et démarches CPAM
- Indemnités journalières auto-entrepreneur : comment ça marche ?
- Congé maternité en micro-entreprise : droits et montants 2026
À bientôt sur le blog MicroDesk.
