Mise à jour septembre 2026. Les plafonds et seuils Ameli / Urssaf ont évolué. Pour une checklist 2026 (démarches CPAM, Cerfa sécurisé, comparatif artisan vs profession libérale réglementée), voir aussi : Arrêt maladie micro-entreprise 2026 : checklist IJ, plafonds et démarches CPAM. Contexte rattachement CPAM : assurance maladie auto-entrepreneur. Prestations maternité : congé maternité en micro-entreprise.
En tant qu’auto-entrepreneur, vous n’êtes pas à l’abri d’un arrêt de travail pour maladie, accident ou hospitalisation. Et comme c’est le cas pour les salariés, vous pouvez dans ces cas bénéficier d’une compensation versée sous la forme d’indemnités journalières. Cependant, vous devez savoir que le droit à cette compensation est soumis à des conditions. Quelles sont ces conditions ? Comment sont calculées les indemnités journalières pour un micro-entrepreneur ? Et comment en bénéficier ? Explications.
Auto-entrepreneur, quelles sont les conditions pour prétendre aux indemnités journalières ?
Dans une situation d’incapacité de travail, l’auto-entrepreneur (désormais micro-entrepreneur) peut bénéficier d’indemnités journalières (IJ). Cependant, hors situation sanitaire exceptionnelle, il doit répondre à quelques critères. Ainsi, pour bénéficier des indemnités journalières, vous devez :
- être un auto-entrepreneur artisan, commerçant ou qui exerce une profession libérale ;
- justifier d’une affiliation d’au moins 12 mois continus au titre de l’activité indépendante (Ameli) ;
- être en activité ou en situation de maintien de droit ;
- percevoir un revenu d’activité annuel moyen (RAAM) d’au moins 4 582 € (seuil 2026 ; sous ce seuil, l’IJ calculée sur le RAAM peut être nulle pour les artisans/commerçants) ;
- bénéficier d’un arrêt de travail dont les volets 1 et 2 doivent être transmis à votre CPAM sous 48 heures (télétransmission préférable ; Cerfa papier sécurisé obligatoire depuis le 1er juillet 2025).
Trouver une assurance Indemnités journalières ?
Il est tout à fait possible de souscrire une assurance pour pallier une perte de revenus, suite à un arrêt maladie. Cela vous permettra alors de compenser les pertes financières, si vous ne percevez plus la totalité de vos revenus.
Sachez que cela ne s’adresse pas uniquement aux auto-entrepreneurs. En effet, même les salariés peuvent se renseigner à ce sujet, tout comme les travailleurs indépendants et les professions libérales. Suivant le contrat que vous signez, il est même possible d’y inclure votre conjoint.e.
Au niveau du montant des indemnités, il existe des contrats basés sur un forfait et d’autres où vous devez déclarer le montant de vos revenus, chaque année. Il est alors question de contrat indemnitaire. Bien entendu, avant de prendre votre décision, nous vous invitons à demander des devis comparatifs d’assurance maintien de salaire. Vous pouvez évidemment le faire en ligne. Cela ne vous prendra que quelques minutes. Il vous sera notamment demandé :
- le capital décès à garantir ;
- le montant des indemnités journalières ;
- si vous désirez inclure votre conjoint.e ;
- si vous désirez une rente éducation.
Par ailleurs, sachez qu’une demande de devis est sans engagement. Vous êtes libre d’y donner suite ou non.
Fonctionnement des indemnités journalières pour micro-entrepreneur
L’arrêt de travail
En tant qu’auto-entrepreneur, si vous vous retrouvez en arrêt de travail et en droit de percevoir des indemnités journalières, vous devez commencer par déclarer votre arrêt maladie. Pour cela, rendez-vous chez un médecin traitant afin qu’il vous prescrive un arrêt de travail. Notons que seuls le médecin traitant, son remplaçant ou un médecin spécialiste sont en mesure de prescrire cet arrêt et déterminer sa durée.
Bon à savoir
L’arrêt de travail est un document composé de plusieurs volets. Seuls les deux premiers sont à envoyer à votre CPAM dans un délai de 48 heures. Si vous n’êtes pas en mesure de le faire, il est possible que votre médecin traitant se charge de le faire directement par télétransmission. Depuis le 1er juillet 2025, un Cerfa papier doit être le formulaire sécurisé (scans et photocopies rejetés).
La Sécurité sociale des indépendants et la CPAM
Comme son nom l’indique, la Sécurité sociale des indépendants (SSI) est un régime spécifique de protection sociale pour les indépendants. Elle remplace, depuis le 1er janvier 2020/2021 selon les volets, le Régime social des indépendants (RSI). Désormais, les indépendants sont donc en majorité rattachés au régime général, avec des interlocuteurs dédiés.
La SSI s’adosse ainsi au régime général de Sécurité sociale, tout en gardant des spécificités pour les indépendants. Tout ce qui concerne les arrêts de travail pour maladie, grossesse ou hospitalisation dépend donc de la Caisse primaire d’Assurance maladie (CPAM). Cela permet aux micro-entrepreneurs de bénéficier d’une protection équivalente à celle des salariés.
Les prestations sont donc pratiquement les mêmes, même si les cotisations sociales sont calculées différemment. Elles incluent entre autres :
- une assurance maladie aussi bien pour vous que pour les membres de votre famille ;
- une Couverture maladie universelle (CMU), en cas de faibles revenus ;
- une assurance maternité ;
- un congé paternité et accueil du nouveau-né.
Notons cependant que la couverture du régime général est limitée. Ceci pour la simple raison que vos cotisations, en tant qu’auto-entrepreneur, sont en dessous de celles d’un salarié. Aussi, le micro-entrepreneur n’est pas couvert pour certains risques. C’est le cas par exemple du chômage, des accidents de travail ou encore des maladies professionnelles. Enfin, la prévoyance n’est pas souvent assez élevée pour compenser les pertes de revenus, en cas de maladie, d’accident ou de décès. Pour le détail du rattachement CPAM, voir aussi assurance maladie auto-entrepreneur.
Calcul des indemnités journalières : le RAAM
Comme vous le savez déjà, l’une des principales conditions pour bénéficier des indemnités journalières est de justifier d’un Revenu d’activité annuel moyen ou RAAM. Pour un arrêt débutant en 2026, le seuil de référence Ameli s’établit à 4 582 € (sous ce seuil, l’IJ peut être nulle pour les artisans/commerçants). Il s’agit d’une moyenne qui s’obtient en divisant par 3 la somme des revenus perçus au cours des 3 dernières années d’activité.
Pour le micro-entrepreneur, notons que le RAAM correspond au CA annuel après abattement. À ce propos, il faut rappeler que le taux d’abattement en micro-entreprise dépend du type d’activité que vous exercez. Pour atteindre environ 4 582 € de revenu après abattement, cela correspond en ordre de grandeur à :
- 71 % pour les activités commerciales ; soit un CA d’environ 15 800 € ;
- 50 % pour les activités artisanales ; soit un CA de 9 164 € ;
- 34 % pour les professions libérales ; soit un CA d’environ 6 943 €.
Pour déterminer maintenant votre indemnité journalière, il suffit d’utiliser la formule : RAAM / 730.
Toutefois, vous devez savoir qu’en fonction de votre statut, le montant de l’indemnité ne sera pas le même (barèmes Ameli actualisés au 1er septembre 2026) :
- artisans, commerçants et professions libérales non réglementées en micro : jusqu’à 65,84 € bruts/jour (plafond de revenus retenus = 1 Pass, soit 48 060 €) ;
- professions libérales réglementées : jusqu’à 197,51 € bruts/jour (plafond = 3 Pass).
Pour le détail opérationnel 2026 (checklist, tableau artisan vs PL, Cerfa), voir le guide complémentaire Arrêt maladie micro-entreprise 2026.
Le délai de carence
Pour les auto-entrepreneurs et comme c’est le cas pour les salariés, la CPAM applique un délai de carence entre le début de l’arrêt de maladie et le versement des indemnités journalières. Ce délai est en principe de 3 jours (versement au 4e jour). Il peut ne pas y avoir de délai de carence dans certains cas prévus par Ameli (par exemple prolongation après une reprise ≤ 48 h, ALD sur la période, interruption spontanée de grossesse).
